Phù thủy nổi tiếng Harry Potter đang gặp một vấn đề lớn, Chúa tể Voldemort lại một lần nữa thoát ra và khủng bố Hogwarts. Harry đang bận rộn với những nhiệm vụ phép thuật quan trọng, vì vậy trò chơi Harry Potter in Trouble đã triệu tập những nhân vật tầm cỡ khác đến giúp đỡ thị trấn, nơi đặt ngôi trường pháp thuật yêu quý của cậu. Họ không ai khác chính là Tổng thống Hợp chủng quốc Hoa Kỳ, Barack Obama. Tuy nhiên, một nhiệm vụ thực sự khó khăn đang chờ đợi. Trong cuộc phiêu lưu này, họ sẽ phải tìm một số lượng lớn các cổ vật cần được sử dụng. Vị tổng thống Mỹ đáng mến thậm chí sẽ phải học cách sử dụng đũa phép để thực hiện một số phép thuật cơ bản, những phép thuật sẽ rất hữu ích khi chơi.